Introdução à análise geoespacial com R

Programa de Pós-Graduação em Ecologia, Evolução e Biodiversidade

Docente responsável
Prof. Milton Cezar Ribeiro

Docente convidado
Prof. Maurício Humberto Vancine

Período
19/10/2020 - 30/10/2020

Créditos
60 horas (4 créditos)

Vagas
10 + 5 especiais

Resumo
A disciplina oferecerá os principais conceitos teórico-práticos introdutórios de análises geoespaciais aplicado à Ecologia. A parte prática será desenvolvida através de ferramentas na linguagem R. Serão abordados os seguintes temas: (1) controle de versão, Git e GitHub, (2) introdução e funcionamento da linguagem R e do software RStudio, (3) estrutura e manejo de dados na linguagem R, (4) funcionamento do tidyverse, (5) estrutura e fonte de dados geoespaciais, (6) manejo dados geoespaciais (vetor), (7) manejo dados geoespaciais (raster) e, (8) produção de mapas. A carga horária total será de 60 horas, onde nos cinco dias iniciais serão ministrados 6 horas teóricas-práticas, num total de 30 horas. As 30 horas restantes serão direcionadas à realização de exercícios práticos, que serão aplicados remotamente como forma de avaliação para compor a nota final da disciplina. Após a realização da disciplina, espera-se que os alunos adquiram conceitos gerais da estrutura e manipulação de dados geoespaciais, assim como domínio das técnicas e métodos para alcançar autonomia e produzir soluções para suas próprias questões relativas ao geoprocessamento utilizando a linguagem R.

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Informações aos participantes

Datas e horários
Teórico-prático: 19/10 – 23/10 [09 h - 12 h | 14 h - 17 h] (30 horas)

Exercícios-atividades assistidas remotamente: 26/10 – 30/10 (30 horas)

Plano de ensino
pdf

Contato
Para mais informações ou dúvidas, envie e-mail para Maurício Vancine (mauricio.vancine@gmail.com)

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Instruções aos participantes

Hardware
Será necessário que todos usem seus notebooks

Softwares
R, RStudio e git

1. Instalar a versão mais recente do R (4.0.x) e RStudio (1.3.x)
   Vídeo de instalação do R e do RStudio
   Curso da linguagem R

2. Instalar o git (2.28)
   Vídeo de instalação do git
   

Linux (Ubuntu e Linux Mint)

# r
sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
sudo add-apt-repository "deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/"
sudo apt update
sudo apt install -y r-base r-base-core r-recommended r-base-dev

# r spatial
sudo add-apt-repository ppa:ubuntugis/ubuntugis-unstable
sudo apt update
sudo apt install -y libudunits2-dev libgdal-dev libgeos-dev libproj-dev

# rstudio
wget -c https://download1.rstudio.org/desktop/bionic/amd64/rstudio-1.3.1093-amd64.deb
sudo dpkg -i rstudio-1.3.1093-amd64.deb
sudo apt install -fy
rm rstudio-1.3.1093-amd64.deb

# git
sudo add-apt-repository ppa:git-core/ppa 
sudo apt update
sudo apt install -y git

Instalar os pacotes no R
Com o R e o RStudio instalados, baixe esse script (scripts são roteiros que possuem comandos, como um rascunho).
Abra o script (00_script_install_r_packages.R) no software RStudio e rode cada linha de comando para instalar os pacotes, necessário estar conectado à internet.
Para rodar as linhas, basta colocar o cursor na linha de código a ser executada e precionar: Ctrl + Enter, como mostra o gif abaixo:

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