数据格式设计

[ShixiangWang]

以表格为基础，建立单一的数据表存储单个数据集

以数据表为基础，建立某种数据的数据集，并用一个表格标注元信息，包括创建时间，与其他数据库数据表关联，引用等

实现方式，使用较为宽松的S3，并定义一系列的泛型方法

[ShixiangWang]

Metadata for dataset should at least contains:

• Attribution
  • Source: URL
  • Description: describe data preprocessing, meaning of columns etc.
  • Unit
  • Citation: reference, separated by ;
  • Software: NA or softwares, separated by ;
  • LastModified: recent update date-time
  • Note: extra info users may should know
• Maintainer
  • Name
  • Email

Rows representing samples and columns representing variables.

Classes to do:

DataTable: element of a DataBase
DataBase: A database for storing similar data, contains a table connect data tables cross different databases.

DataBase to do:

• ImmuneFraction
• ImmuneResponse
• Phenotype

[ShixiangWang]

一个数据表是一个 rds 数据，存放到 extdata 中，而数据库元信息表则存储到 data 下面。